5 αυτοματοποιημένο λογισμικό καρυοτύπων για τη χαρτογράφηση των χρωμοσωμάτων σας

Η καρυοτυπία είναι η διαδικασία της παραγγελίας και του ζευγαρώματος όλων των χρωμοσωμάτων που βρίσκονται σε έναν οργανισμό, προκειμένου να αποκτηθεί μια ολοκληρωμένη εικόνα του χάρτη ολόκληρων χρωμοσωμάτων ενός ατόμου.

Αλλά ας αρχίσουμε πρώτα να σιγουρευτούμε ότι καταλαβαίνουμε τι είναι τα χρωμοσώματα στην πρώτη θέση. Τα χρωμοσώματα είναι δομές που μοιάζουν με σπειρώματα που περιέχονται στον πυρήνα καθενός από τα κύτταρα του σώματός σας.

Κάθε δομή χρωμοσωμάτων περιέχει ολόκληρο το σχέδιο γενετικής πληροφόρησης του σώματός σας. Αυτό υπαγορεύει τον τρόπο δομής του σώματός σας, αντιδρά σε ερεθίσματα, προδιάθεση σε ασθένειες κ.λπ. Οι γυναίκες έχουν χρωμοσώματα 2 'Χ' και οι άνδρες έχουν ένα χρωμόσωμα 'Χ' και ένα 'Υ'. Κάθε κύτταρο του σώματός σας περιέχει 23 ζεύγη χρωμοσωμάτων, 46 χρωμοσώματα συνολικά.

Προκειμένου οι ερευνητές να κατανοήσουν τις αλληλουχίες των χρωμοσωμάτων κάθε ασθενούς, χρησιμοποιούν λογισμικό καρυοτύπων . Αυτός ο τύπος λογισμικού έχει σχεδιαστεί για την ανάλυση χρωμοσωμάτων και αξιολογεί τη δομή και τον αριθμό των χρωμοσωμάτων ενός ατόμου. Με αυτόν τον τρόπο, οι ερευνητές και οι επιστήμονες μπορούν να ανιχνεύσουν ανωμαλίες.

Σε αυτό το άρθρο, θα διερευνήσουμε μερικές εξαιρετικές επιλογές λογισμικού που σας επιτρέπουν να κάνετε ανάλυση καρυοτύπων.

Κορυφαία 5 αυτοματοποιημένα εργαλεία καρυοτύπων για χρήση το 2019

1

ArgusSoft

Το ArgusSoft είναι μια εξαιρετική επιλογή λογισμικού που σας επιτρέπει να κάνετε αυτόματα καρυότυπους ανθρώπινα χρωμοσώματα με τη θέση ζώνης και μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την καρυοτυπία των ζώων και των χρωμοσωμάτων των φυτών στο διαδίκτυο.

Βασικά χαρακτηριστικά:

  • G, Q, R
  • Αυτοματοποιημένος καρυοτύπος ανθρώπινων χρωμοσωμάτων με αναγνώριση των στροφών
  • Αυτοματοποιημένος καρυοτύπος χρωμοσωμάτων χοίρου
  • 3 ενσωματωμένες βάσεις από πρότυπα ιδεογράμματα ανθρώπινων χρωμοσωμάτων με διάφορα επίπεδα διαχωρισμού - 400, 550 και 850 επίπεδα
  • Μπορεί να προσθέσει βάσεις πρότυπων ιδεογραμμάτων χρωμοσωμάτων για άλλα είδη ζώων και φυτών
  • Μέθοδοι προετοιμασίας δειγμάτων
  • Εισαγωγή εικόνων μεταφάσεων με κάμερα και σαρωτή
  • Συνοδεύει μια εικόνα με γραφικά
  • Αυτοματοποιημένη κατανομή εφαρμοζόμενων και επαφών χρωμοσωμάτων
  • Σύγκριση χρωμοσωμάτων και ιδεογραμμάτων

Μπορείτε επίσης να χρησιμοποιήσετε το ArgusSoft για να εκπαιδεύσετε το σύστημα αναγνώρισης χρωμοσωμάτων χρησιμοποιώντας προκαθορισμένες προετοιμασίες, να μεταφέρετε εικόνες μεταφραστικής πλάκας και καρυογράμματα σε ενσωματωμένη βάση δεδομένων, να παράγετε μοτίβα αναφορών, σωστά καρυογράμματα και επίσης να αποθηκεύετε και να εκτυπώνετε εικόνες και αποτελέσματα ανάλυσης.

Μπορείτε να πάρετε εκπαίδευση και υποστήριξη για τη χρήση του ArgusSoft από την επίσημη ιστοσελίδα τους. Το κέντρο υποστήριξης περιλαμβάνει υπηρεσίες εκπαίδευσης, συντήρησης και παροχής συμβουλών.

Δοκιμάστε το ArgusSoft

2

HiBand από Applied Spectral Imaging

Το HiBand είναι ένα λογισμικό που δημιουργήθηκε από την Applied Spectral Imaging, η οποία μπορεί να εκτελέσει προηγμένη ανάλυση χρωμοσωμάτων χρησιμοποιώντας ψηφιακά χαρακτηριστικά καρυοτύπων. Αυτό το λογισμικό

χρησιμοποιεί αυτοματοποιημένες δυνατότητες σάρωσης για μια εις βάθος ανάλυση της δομής χρωμοσώματος.

Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε το ευρύ φάσμα λειτουργιών που βρίσκονται στο HiBand για τη δημιουργία ευρετηρίων, την καταμέτρηση, την αποθήκευση και τη διαχείριση δεδομένων αποτελεσμάτων. Μπορείτε επίσης να χρησιμοποιήσετε αυτό το ισχυρό λογισμικό για αυτόματη σάρωση της ακολουθίας χρωμοσωμάτων.

Τα αποτελέσματα που προέκυψαν από τη χρήση των χαρακτηριστικών καρυοτύπων που βρέθηκαν στο HiBand μπορούν να αποθηκευτούν σε ασφαλή τοποθεσία με προστατευμένα με κωδικό και κρυπτογραφημένα στρώματα. Αυτό σας επιτρέπει να είστε ειλικρινείς όσον αφορά την απώλεια σημαντικών δεδομένων αλληλουχίας και, λόγω αυτού, βελτιώνει επίσης την αποτελεσματικότητα του εργαστηρίου σας.

Η ταξινόμηση μέσω των αποτελεσμάτων γίνεται με πολύ εύκολο τρόπο, απλά πρέπει να αναζητήσετε τη συγκεκριμένη ακολουθία χρωμοσωμάτων και όλα τα αποτελέσματα εμφανίζονται σε μια καλή οθόνη που προσφέρει εύκολη πρόσβαση για να τροποποιήσετε, να αναθεωρήσετε και επίσης να προσθέσετε ετικέτες σε οποιαδήποτε των αρχείων.

Βασικά χαρακτηριστικά:

  • Brightfield Karyotyping-G-Band και R-Band
  • Φασματοσκοπία φθορισμού-Q-Band, R-Band και FISH
  • Φασματικό Καρυοτύπου
  • Αυτόματη μέτρηση χρωμοσωμάτων
  • Χαρτοσκόπηση και ταξινόμηση χρωμοσωμάτων
  • Προχωρημένος διαχωρισμός χρωμοσωμάτων και προηγμένη ενίσχυση εικόνας
  • Γκαλερί εικόνων - μπορεί να παρουσιάσει όλες τις μεταφάσεις των περιπτώσεων και τους καρυότυπους σε μία οθόνη
  • Μπορούν να συγκρίνουν τα χρωμοσώματα - να τα βλέπουν πλάι-πλάι
  • Abnormal Ideogram - μπορείτε να προσθέσετε χρωμοσώματα, κελιά, ιδεογράμματα και σχολιασμούς σε μια γεννήτρια εικόνων

Το HiBand χρησιμοποιεί πλήρως αυτοματοποιημένες ροές εργασίας για αύξηση της εργαστηριακής απόδοσης, διαθέτει λειτουργίες σάρωσης "start-and-walk-away", βρίσκει μεταφάσεις, διαβάζει αυτόματα τους γραμμικούς κώδικες, ανεβάζει εικόνες σε πραγματικό χρόνο κατά τη διάρκεια της σάρωσης διαφανειών και επίσης εξάγει στο εργαστήριο LIS Central Portal Βάση δεδομένων.

Δοκιμάστε το HiBand

3

Ikaros από την MetaSystems

Αυτό το σύστημα καρυοτύπων έχει ένα πολύ έξυπνο περιβάλλον χρήστη που προσφέρει όλα τα χαρακτηριστικά σε μια οθόνη. Αυτό επιτρέπει την εύκολη και γρήγορη πρόσβαση σε όλες τις πληροφορίες που λαμβάνονται.

Ο Ikaros μπορεί να χρησιμοποιηθεί με Neon, η οποία είναι μια πλατφόρμα που σχεδιάστηκε για να βοηθήσει με τα δεδομένα εικόνας και την οργάνωση των περιπτώσεων. Το Neon συλλέγει δεδομένα από όλες τις εργασίες απεικόνισης, εξωτερικές πηγές και σας επιτρέπει να τα παρουσιάζετε με έναν εύκολο τρόπο για να το καταλάβετε χρησιμοποιώντας ένα ταμπλό διαχείρισης περιπτώσεων.

Αυτό το εργαλείο σάς επιτρέπει πάντα να έχετε σημαντικές πληροφορίες στο χέρι και αποθηκευμένες με ασφαλή τρόπο, αλλά χρησιμοποιεί πολύ ισχυρούς αλγορίθμους διαχείρισης δεδομένων, έχει ένα ευρύ φάσμα τρόπων για την παρακολούθηση δεδομένων και μπορεί να παρέχει συγκεκριμένες αναζητήσεις βασισμένες σε λέξεις-κλειδιά και χαρακτηριστικά δεδομένων.

Δείτε περισσότερες πληροφορίες σχετικά με το Neon και τα χαρακτηριστικά του εδώ .

Ο Ikaros υποστηρίζει πολλές διαφορετικές τεχνικές συγκόλλησης - Brightfield G-Band και R-Band, φθορισμού Q-Band, R-Band και FISH - προσφέρει μεγάλο αριθμό προκαθορισμένων μορφών καρυόγραμμα για ανθρώπους, φυτά και ζώα. Μπορείτε να επεξεργαστείτε εύκολα αυτές τις φόρμες για να προσθέσετε οποιαδήποτε δεδομένα απαιτούνται για τον τύπο της έρευνας που κάνετε.

Το γεγονός ότι μπορείτε να συγκρίνετε τα χρωμοσώματα με την κλάση ή με τα καρυόγραμμα, σας προσφέρει πολύ χρήσιμες πληροφορίες που σας επιτρέπουν να αναγνωρίζετε εύκολα τις διαφορές.

Δοκιμάστε τον Ικάρο

4

MetaClass από τη Microptic

Το MetaClass είναι ένα μεγάλο λογισμικό καρυότυπων που σχεδιάζεται με τρόπο αρθρωτό. Αυτό το λογισμικό σας βοηθά να εκτελείτε μελέτες καρυοτύπων και FISH χρωμοσωμάτων.

Το MetaClass αποτελείται από τις ακόλουθες ενότητες:

  • MetaClass Βάση Δεδομένων

Βάση δεδομένων που μπορεί να εγκατασταθεί με οποιαδήποτε από τις ενότητες του MetaClass. Σας επιτρέπει να αποθηκεύσετε τα στοιχεία του ασθενούς και σας δίνει εύκολη πρόσβαση στα αποτελέσματα. Μπορείτε να δημιουργήσετε προσαρμοσμένες αναφορές σε οποιαδήποτε γλώσσα με αυτήν την ενότητα.

  • Καρυοτυπία MetaClass

Σας δίνει τη δυνατότητα να μελετήσετε έναν καρυότυπο αφού οι εικόνες της φάσης προετοιμασίας μεταφάσεων έχουν καταγραφεί ψηφιακά και να τις τοποθετήσετε σε ζευγάρια με βάση το μέγεθος, τη θέση κλπ. Αυτή η ενότητα σας δίνει εξαιρετικά ποιοτικά αποτελέσματα όταν πρόκειται για ζώνες χρωμοσωμάτων και μπορεί επίσης σας παρέχει επαγγελματικές αναφορές.

Βασικά χαρακτηριστικά περιλαμβάνουν:

  • Η μελέτη του καρυότυπου αναλύεται υπό μεγέθυνση φωτεινού πεδίου 100Χ
  • Μπορεί να συλλάβει αρκετές εικόνες Metaphase
  • Η ποιότητα της εικόνας μπορεί να τροποποιηθεί για καλύτερα αποτελέσματα
  • Αυτόματη ταξινόμηση χρωμοσωμάτων
  • 4 προβολές οθόνης - Παράθυρο μεταφάσεων, καρυότυπων και ασταθών χρωμοσωμάτων
  • Μπορεί να εμφανίσει πρωτότυπα χρωμοσωμάτων
  • Τα χρωμοσώματα που δεν ταξινομούνται μπορούν να διορθωθούν αυτόματα ή με το χέρι - επικάλυψη, διαχωρισμός, διασταυρώσεις, περιστροφές κλπ.
  • Τα αρχεία περιόδου λειτουργίας MTC ή οι εικόνες BMP μπορούν να αποθηκευτούν και να φορτωθούν ξανά ανά πάσα στιγμή
  • Μπορεί να εξάγει μεμονωμένα χρωμοσώματα στη βάση δεδομένων Metaclass με δυνατότητα προσθήκης σχολίων και σημειώσεων

Ακολουθεί ένα παράδειγμα έκθεσης για το karyotyping Metaclass.

  • MetaClass FISH

Πρόκειται για μια ενότητα ανάλυσης που σας επιτρέπει να αποκτήσετε εικόνα φθορισμού σε SITU Hybridization (FISH). Αυτή η ενότητα συλλαμβάνει εικόνες χρησιμοποιώντας ανιχνευτές φθορισμού DNA και σας επιτρέπει να επιβεβαιώσετε τις γενετικές ανωμαλίες - τρισωμίες, πολλαπλασιασμοί, μετασχηματισμοί χρωμοσωμάτων κλπ.

Οι εικόνες FISH αναλύονται υπό μεγέθυνση 100Χ και, για ευρύτερο εύρος διαύγειας εικόνας, μπορούν επίσης να καταγράψουν εικόνες με διαφορετικά φίλτρα.

Αν ενδιαφέρεστε να μάθετε περισσότερες πληροφορίες σχετικά με τις ενότητες που παρουσιάζονται παραπάνω και άλλα χαρακτηριστικά, μπορείτε να δείτε το κατάλογο MetaClass.

Αν είστε περίεργος τύπος και θέλετε να δείτε μια αναφορά που λαμβάνεται χρησιμοποιώντας τη μέθοδο FISH, μπορείτε

ένα δείγμα αρχείου PDF.

Δοκιμάστε το MetaClass

5

GenASis Bandview

Το GenASis Bandview είναι ένα άλλο μεγάλο λογισμικό καρυοτύπων που είναι χτισμένο από μονάδες με διαφορετικά capabitilites. Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε αυτήν την εφαρμογή για να εκτελέσετε διαγνωστικά καρυοτύπων και να λάβετε ακριβή αποτελέσματα δοκιμών.

Αυτό το λογισμικό σας επιτρέπει να προσαρμόσετε πλήρως τη ροή εργασίας και τη διαδικασία διάγνωσης, ανάλογα με τις ανάγκες της εταιρείας σας και τους στόχους που προσπαθείτε να επιτύχετε.

Το ευρύ φάσμα των εργαλείων που παρέχονται στο BandView είναι εύκολα προσβάσιμα με ένα μόνο κλικ του ποντικιού και προσφέρει ισχυρή εμπειρία καρυοτύπων G / R / C / Q-Band. Μπορείτε να επιλέξετε ανάμεσα σε μια αυτοματοποιημένη ή μη αυτόματη ροή εργασίας όταν πρόκειται να εντοπίσετε μεταφάσεις και να καταγράψετε εικόνες.

Οι ανωμαλίες χρωμοσωμάτων, εάν εντοπιστούν, μπορούν να παρατηρηθούν μέσω της προσθήκης, της διαγραφής ή της αναδιάταξης του γενετικού υλικού του ασθενούς. Με το BandView, μπορείτε να χρησιμοποιήσετε ζώνη μοριακής τεχνικής FISH.

Το FISH χρησιμοποιεί ανιχνευτές φθορισμού για να συνδεθεί σε διαφορετικά μέρη του χρωμοσώματος, επιτρέποντας στο λογισμικό να ανιχνεύει και να εντοπίζει τα ανωμαλίες που απαντώνται σε συγκεκριμένες ακολουθίες DNA.

Δοκιμάστε το GenASis Bandview

συμπέρασμα

Σε αυτό το άρθρο, διερευνήσαμε μερικά από τα καλύτερα αυτοματοποιημένα λογισμικά καρυοτύπων που υπάρχουν στην αγορά στα τέλη του 2018.

Οι επιλογές λογισμικού καρυοτύπων που καλύπτονται σε αυτό το άρθρο σας προσφέρουν μια ποικιλία χαρακτηριστικών που θα σας βοηθήσουν να επιτύχετε τους στόχους της εταιρείας σας.

Χρησιμοποιώντας αυτό το είδος λογισμικού, μπορείτε να μετρήσετε γρήγορα χιλιάδες δομές χρωμοσωμάτων, να αναλύσετε με διαφορετικές επαγγελματικές τεχνικές και να δημιουργήσετε αναφορές υψηλής ποιότητας που θα σας επιτρέψουν να εντοπίσετε εύκολα ανωμαλίες.

Θα θέλαμε να μάθουμε ποια είναι η γνώμη σας σχετικά με το λογισμικό που παρουσιάσαμε σε αυτήν την πρώτη λίστα. Μη διστάσετε να μας ενημερώσετε χρησιμοποιώντας την παρακάτω ενότητα σχολίων.

ΣΧΕΤΙΚΟΙ ΟΔΗΓΟΙ ΠΟΥ ΧΡΕΙΑΖΕΤΑΙ ΝΑ ΕΛΕΓΞΕΤΕ:

  • Χρειάζεστε λογισμικό έρευνας για την ακαδημαϊκή έρευνα; Εδώ είναι 5 εργαλεία
  • 5 καλύτερο λογισμικό για την ακαδημαϊκή γραφή
  • 10 το καλύτερο λογισμικό λογοκλοπίας για την ανίχνευση περιεχομένου αντιγράφων το 2019

Συνιστάται

Το Wi-Fi δεν θα ζητήσει κωδικό πρόσβασης: 6 γρήγορες λύσεις για την επίλυση αυτού του προβλήματος
2019
Πλήρης επιδιόρθωση: Δεν είναι δυνατή η αναπαραγωγή των Sims 4 στα Windows 10, 8.1 και 7
2019
Διορθώστε: "πήρατε πολύ χρόνο για να ξεκινήσετε" το σφάλμα του Xbox One
2019